Plot the Raman spectra in a journal prepared format. It may be desirable to plot spectra 'stacked and offset' by a certain amount.
Tracez les spectres Raman dans un format préparé par un journal. Il peut être souhaitable de tracer les spectres 'empilés et décalés' d'une certaine quantité.
Usage
plot_raman_stacked(
raman,
plot_title = "Raman Spectra",
legend_title = "Sample ID",
stack_offset = 10,
lang = NA
)Arguments
- raman
A data.frame in long format with columns `sample_id`, `wavenumber`, and `intensity`. The `intensity` column contains raw Raman counts. The code determines the correct y axis units and labels the plot appropriately based on whether normalization has been applied.
Un data.frame au format long avec les colonnes `sample_id`, `wavenumber`, et `intensity`. La colonne `intensity` contient des compteurs Raman bruts. Le code détermine les unités correctes de l'axe y et étiquette le tracé en conséquence selon que la normalisation a été appliquée ou non.
- plot_title
Title for plot. Defaults to "FTIR Spectra". Vector length 2 uses second element as subtitle. Titre du tracé. Par défaut "FTIR Spectra". Un vecteur de longueur 2 utilise le deuxième élément comme sous-titre.
- legend_title
Title for legend. Defaults to "Sample ID". Titre de la légende. Par défaut "Sample ID".
- stack_offset
The amount in intensity units of stacking offset to use.
Le montant en unités d'intensité de décalage d'empilement à utiliser.
- lang
Optional language argument: `fr`/`french`/`francais`/`français` for French; `en`/`english`/`anglais` for English; `NA` uses default. Argument optionnel pour la langue : `fr`/`french`/`francais`/`français` pour le français ; `en`/`english`/`anglais` pour l'anglais ; `NA` utilise la valeur par défaut.
Value
a ggplot object containing a Raman spectral plot. The plot and legend titles are as provided, with each sample provided a different default color. Because this is a ggplot object, any other ggplot modifiers, layers, or changes can be applied to the returned object.
un objet ggplot contenant un tracé spectral Raman. Les titres de le tracé et de la légende sont tels que fournis, avec une couleur par défaut différente pour chaque échantillon. Puisqu'il s'agit d'un objet ggplot, tous les autres modificateurs, calques ou changements ggplot peuvent être appliqués à l'objet retourné.