Read Raman file

Reads a Raman spectra file and returns a data.frame in the proper format for PlotFTIR functions.

Lit un fichier de spectres Raman et renvoie un data.frame dans le format approprié pour les fonctions PlotFTIR.

Usage

read_raman(path = ".", file = NA_character_, sample_name = NA_character_, ...)

Arguments

path

Path to the file. Default is the current working directory, as ".". Can include the filename, in which case provide NA as the filename.

Chemin d'accès au fichier. Par défaut, il s'agit du répertoire de travail actuel, sous la forme ".". Peut inclure le nom du fichier, auquel cas il faut fournir NA comme nom de fichier.

file

File name, required. If the file and path are provided together as path, then NA is accepted.

Nom du fichier, obligatoire. Si le fichier et le chemin sont fournis ensemble en tant que chemin, alors NA est accepté.

sample_name

Name for sample_id column in the returned data.frame. If not provided, the file name is used without the extension.

Nom de la colonne sample_id dans le data.frame renvoyé. S'il n'est pas fourni, le nom du fichier est utilisé sans l'extension.

...

Additional parameters to pass to the file reading function.

Paramètres supplémentaires à transmettre à la fonction de lecture de fichier.

Value

a data.frame containing the Raman spectral data from the file, with attributes: intensity set to "raman", and raman_metadata containing the KEY=VALUE header lines (introduced by one or more #) parsed as a named list.

un data.frame contenant les données spectrales Raman du fichier, avec les attributs : intensity défini sur "raman", et raman_metadata contenant les lignes d'en-tête KEY=VALUE (introduites par un ou plusieurs #) analysées sous forme de liste nommée.

Examples

# Reading a Raman file:
# raman_data <- read_raman("./data/Graphite_Raman.txt")